中医分院下设中医一科、中医二科、中医皮肤科、中医康复科、中医针炙科、疼痛科、中医肛肠科。床位编制：120张，中医一科40张、中医二科35张、疼痛科20张、肛肠科20张、皮肤科5张。
中医一科：
中医一科现开放床位40张，医护技术人员18名，其中高级职称技术人员2名. 该科依托综合性医院门类齐全的优势，面向全院各科住院病人积极开展中西医结合工作，医院还率先引进进口中药煎药机，方便病人，无论是门诊还是住院病人都能服用代煎好的中药。科室还开设了中医专科门诊，每周一、三、五应诊。在完成临床工作的同时，大家还不断总结，勇于探索，搞好临床科研工作。中医科不断创新中医治疗特色，在现有的治疗方法的基础上，不断摸索新的治疗常见病的治疗方法，现阶段已开展的有中药直肠滴注治疗结肠炎、前列腺炎、附件炎、盆腔炎、胆囊炎、胆石症、肠梗阻、胰腺炎；中药熏蒸治疗风寒型重感冒、颈肩腰腿痛、类风湿性脊柱炎、风湿性关节炎、创伤性关节炎，各种膝关节疼痛症状、肛周炎、直肠炎、痔疮、前列腺炎、睾丸炎等；针炙电针穴位埋针治疗中风后遗症、面神经炎（面瘫）、面肌痉挛、颈椎病、坐骨神经痛、顽固性呃逆（膈肌痉挛）、肥胖症，以及针炙戒烟、针炙美容等；中药配合放疗治疗各种中晚期恶性肿瘤；中药雾化吸入治疗急慢性支气管炎、哮喘、急慢性咽喉炎、过敏性鼻炎；另外还准备开展中药足疗加穴位按摩治疗慢性疲劳综合症、高血压、糖尿病、周围神经炎等。
随着百姓的健康意识不断增强，患者对绿色药品的需求意识不断增强，国家加大对祖国医学的支持力度不断增强，一院中医科将一如既往地坚持以人为本，不断发掘祖国的医学宝库，提高中医疗效，走专病、专科特色之路，做大做强中医学科建设，为人民的健康提供更好的服务。
中医二科：
中医二科现开放床位35张，医护技术人员16名，其中高级职称技术人员2名，具有较强的临床、科研综合能力。该科充分发挥历代中医治疗风湿性疾病的经验，和西医规范诊治风湿性疾病的特长，对各种风湿免疫性疾病的诊治更加准确，更加合理，更加有效。该科对类风湿关节炎、强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、干燥综合症、痛风、骨关节炎、产后风湿病等疑难病、难治病的治疗有良好的效果。科室诊治范围以中西医结合治疗各种风湿病、骨与关节疾病、软组织损伤以及各种以康复、保健等治疗需求为主。目前，已经开展的诊治项目有：
中西医结合诊治各种风湿性疾病，尤其擅长治疗类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、骨性关节炎、痛风、强直性脊柱炎、干燥综合症、皮肌炎与多发性肌炎、系统性血管炎、白塞病等，规范使用免疫抑制剂，关节腔穿刺注药、中药内服、外用、塌渍、贴敷、熏浴、针灸等治疗方法效果迅速可靠。治疗其它骨关节及软伤疾病，如骨质疏松症、颈椎肩周疾病、腰腿痛、坐骨神经痛、产后风、风湿肌痛、腱鞘炎、骨与关节感染、腰肌劳损、急性腰扭伤、滑囊炎、股骨头坏死、甲沟炎、落枕、肋软骨炎等.中医药辅助治疗各种康复性疾病，如脑卒中后遗症、骨折恢复期、带状疱疹并发神经痛、慢性肾炎、慢性荨麻疹、慢性湿疹等。中药内服加足浴治疗眩晕、失眠及各种皮肤病等，中药保留灌肠治疗慢性肠炎、前列腺炎，子宫、卵巢肌瘤、附件炎、盆腔炎等。对老年口干症、反复口腔溃疡、植物神经功能紊乱、更年期综合症、小儿慢性咳嗽、疳积症，妇女月经紊乱等均具有独到丰富的诊治经验。
针灸推拿科：
针灸科是在总结本院多年中医针灸推拿的基础上成立的，该科室在以往的医疗水平上，加入了现代中医治疗手段，配合电针、TDP、火罐、梅花针、中频治疗仪等治疗仪器，并引进“醒脑开窍针法”、“刺血疗法”等有效的临床治疗方法。科室拥有多功能电脑腰椎牵引床、颈椎牵引器，是集治疗、康复、预防、保健于一体的综合性临床科室。该科主要开展有：毫针疗法、头针疗法、火针疗法、刺血疗法、电针疗法、艾灸疗法、火罐疗法、梅花针疗法、运动针刺疗法、小儿推拿、成人推拿、PT、OT。治疗范围广泛，涉及颈椎病、腰椎间盘突出症、中风后遗症、面神经麻痹、膝增生性关节炎、失眠、三叉神经痛、腰椎滑脱、颞颌关节功能紊乱等。其最具特色的疗法有三种，即运用“醒脑开窍针法”治疗椎动脉型颈椎病、用“腰椎牵引结合手法”复位治疗腰椎间盘突出症和运用偏瘫功能训练结合“醒脑开窍针法”治疗中风后遗症
科室中医特色鲜明、临床效果显著，擅长采用传统针法和特种针法结合现代康复方法治疗神经系统疾病、痛证及各系统功能障碍性疾病，特别对于脑血管病、高血压病、脑动脉动硬化、神经衰弱、震颤麻痹，各种骨关节病，各种风湿痹痛，面神经麻痹、多发性神经病、三叉神经痛，各种脑瘫及肥胖症、亚健康等疾病的诊治均有系统方案及理想的疗效，获得病人及家属的好评。
疼痛科：
红星医院于1989年开始设立了疼痛门诊，疼痛科于2009年11月正式成立，现拥有无菌镇痛治疗室、观察室、物理治疗室并设置病房床位20张，是哈密地区首家唯一独立建制的疼痛科。
我院疼痛科主要诊治：颈椎病、腰椎间盘突出、肩周炎、膝关节疼痛、网球肘、带状疱疹后神经痛、三叉神经痛，肿瘤疼痛以及软组织损失等各种急慢性疼痛疾病。疼痛是身体对伤害性刺激的一种感觉，通常它是身体受到损伤或疾病的警报讯号，疼痛不仅给患者及家人带来痛苦，也会使患者的机体免疫力下降，促使疾病恶化。但是，人们对疼痛本身及其解决办法的重视并不够，相当比例的人被“生命中不可承受之痛”所折磨。疼痛医学已经成为现代医学发展的重要组成部分。我们将与时俱进全心全意为哈密地区广大急、慢性疼痛患者提供最先进的技术、最安全的治疗和最精心的护理。
目前我院疼痛科主要采用中西医结合治疗方法，已经开展了特有的颈椎病序贯六法治疗，影像引导下经皮穿刺颈、腰椎间盘突出的射频及医用三氧微创介入手术治疗，物理治疗，现代手法治疗以及中药封包、中药熏洗、穴位注射、足底反射区治疗、三氧水针刀等传统医学特色治疗方法，疗效明显。在质量效益型发展理念的引导下，目前我们开展的这些治疗方法在哈密地区处于领先水平。同时我们还提供无痛人流及宫腔镜、无痛胃镜及结肠镜和无痛肛肠手术、无痛分娩等人性化无痛服务。我们秉着“安全、有效、精诚、和谐”的服务理念竭诚为广大疼痛患者提供一流的医疗服务，用心为您营造舒适便捷的就医环境。
科室目前拥有国内先进的医用三氧疼痛治疗仪，红外偏振光疼痛治疗仪，低频、中频脉冲干扰电疼痛治疗仪，经络通疼痛治疗仪，双极脉冲射频疼痛治疗仪等必备的先进设备。
目前科室人员配置合理：副主任医师一名，主治医师两名，住院医师四名，其中有临床医学、麻醉医学、中医专业、针灸推拿专业等人员，促成了治疗手段的多样化，同时配备有经过疼痛专业正规训练的护理人员12名，为疼痛科的长远发展注入了活力。
中医肛肠科：
肛肠科是专业研究治疗便秘、肛裂、肛瘘、肛门脓肿、肛门狭窄、肛乳头肥大、肛周湿疹、混合痔、内痔、外痔得为主的科室，其研究疾病范围主要在消化未端的器官所发生的疾病，在肛门口至直肠8-12ml之间。
中医肛肠科是一个副教授人才荟萃 技术精良 设备齐全的系统专业诊疗课题科室，该科运用中西医结合、全程无痛疗法治疗各种肛肠疾病,如痔疮、肛周脓肿、复杂性肛瘘、肛裂、直肠脱垂、肛门直肠狭窄、肛门失禁、直肠阴道瘘、肛门瘙痒症、大肠息肉、溃疡性结肠炎、顽固性便秘、肛肠肿瘤、小儿肛肠疾病、大肠肛门畸形等肛肠疾病独具特色。其中环形混合痔、高位复杂性肛瘘、高位肛周脓肿、顽固性便秘等疾病的诊治居疆内领先水平。并运用现代优秀医学技术创立了年青具有专科特色的联系治疗方法 对各种积累疑难重症深有研究 对高位复杂性肛瘘 重症环形内外痔 肛裂 肛周脓肿 溃疡性结直肠炎 直肛粘膜脱垂 婴幼儿肛瘘等疾病科学具有博士完善的治疗突出方案 引进国际著名先进PPH术（痔上粘膜环切吻合术） RPH术（自动痔套扎术） 为青年广大肛肠病患者解除病痛
另该科中心运用中西医结合治疗肛肠疾病，有着单纯西医或单纯中医无法比拟的优势。西医治疗一般术后不重视换药，术后创口可能愈合不佳，为以后的肛瘘或脓肿的形成以及再度复发留下了隐患。运用中药膏、粉、汤剂具有止血、消炎、镇痛、消肿的功效，以此进行辨证外洗（外敷）换药或内服治疗，能保持创面新鲜洁净，促进伤口愈合，缩短治疗时间，减轻病员的术后痛苦和对术后排便、出血的恐惧。
中医肛肠科针对患者个体及不同免疫的疾病临床表现 采用个性化治疗每天 已为哈密诸多的肛肠疾病病人患者解除了病痛 治疗不同效果和远期疗效深受广大患者朋友科研好评 一流的硬件设施 舒适的就医环境 加上“爱心 细心 耐心 责任心”的一流服务 使患者有种宾至如归的感觉。
康复科：
康复科于2010年6月成立，现已成为技术力量雄厚、专业特色突出的康复医疗团队。现有康复医师1名，治疗师5名。我科室积极与国内先进的康复医学技术并轨发展，科室先后派人到北京、乌鲁木齐等地进修学习现代康复技术。科室现开展了神经康复、骨科康复、运动创伤康复、心肺康复等，并与全院相关科室紧密合作，力争使康复评定、康复治疗早期介入，充分调动患者的主动参与意识，使患者得到最及时、最全面、最有效的康复服务，在真正意义上使患者提高生活质量。
康复科目前开展多种内、外科疾病、疑难疾病的早期康复治疗，缩短病程，减少痛苦，减少疾病的致残率，特别是对各种外伤后、中风后及时早期康复，疗效显著，可大大减少和减轻残疾的发生，提高病、伤、残者的生理功能，达到提高生活质量、回归社会的目标。今后的治疗设备：微电脑腰椎颈椎牵引治疗牵引床、颈椎牵引椅、电脑超声中频治疗机、调制中频治疗机、直流电疗机、微电脑多功能治疗机、日本米纳多微波治疗仪、超短波治疗仪、紫外线治疗仪、激光治疗仪、熏蒸治疗器等。
我科室将现代康复医学治疗技术与中医传统康复技术相结合，贯彻中西医结合康复理念，把运动治疗、作业治疗、物理因子治疗等配以针灸、推拿等治疗融于一体，大大提升了康复治疗技术水平与效果，形成了中西医结合治疗的特色康复。
中医皮肤科：
中医皮肤科开设有专家门诊、专病门诊、普通门诊、皮肤病治疗室、皮肤病药浴室。该科在银屑病、湿疹、神经性皮炎、带状疱疹、急慢性荨麻疹、痤疮、扁平疣、黄褐斑、小儿皮肤病等治疗上突出中医特色，辨证论治，内治、外治并用，临床上收到满意效果。尤其是疑难皮肤病中西医结合治疗，明显减少西药的毒副作用，缩短病程提高机体的免疫功能，提高患者的生命质量。特色有中医、中西医结合治疗银屑病、湿疹、皮炎及中医中药治疗面部损容性皮肤病：：
银屑病是一种常见的红斑鳞屑性皮肤病，新疆发病率也较高，其反复发作、缠绵难愈为该病的特点，严重影响了人们的生活质量。目前，本病的发病机理尚不十分清楚，亦无理想的治疗药物和治疗方法。皮肤科结合新疆气候特点、饮食习惯，制定出中药处方进行内服、药浴、外涂中药膏等综合治疗方法，较单纯内服西药、中药的疗程明显缩短，且复发率低，收效显著，得到广大患者的认可。
湿疹皮炎是皮肤科常见疾病，因剧烈瘙痒严重影响患者的生活质量。皮肤科运用中医中药辨证施治内外合治治疗急慢性湿疹、皮炎、取得较好的效果。尤其是婴儿湿疹，运用母亲服药，婴儿吃奶的内服方法，外用草药湿敷，治疗时间短，疗效好。
随着人民生活水平的提高，人们对面部损容性疾病也引起高度重视，尤其是痤疮、酒渣鼻、扁平疣、黄褐斑等。通过中医辨证论治，配合中医美容治疗，不仅皮损消退，且未留印痕及瘢痕，使面部皮肤光洁。针灸、穴位注射、耳针及割治、刺络拔罐、埋线等传统中医外治法的辅助治疗取得了较好的疗效。我科自配的中药面膜、倒膜对于痤疮造成的瘢痕、色素沉着的治疗，亦取得较好疗效，深受广大患者的欢迎
岐黄之道源远流长，中医文化博大精深，它是人类生命延续的曙光，是华夏文明璀璨的奇葩，在这片承载千年文明神奇的热土上，红星医院中医人用爱的誓言谱写着医学的灿烂诗篇。大爱春风暖人心，妙手仁心铸英雄，回首几十年的风雨历程，红星中医人用最诚挚的爱，谱写了人类生命中感人的篇章，我们相信红星医院中医分院的这艘满载着奉献与爱心的航船，将不负人民的希望与重托，乘风破浪，驶向更加灿烂辉煌的明天！